质谱的进步彻底改变了蛋白质组学领域。然而,在蛋白质翻译后修饰(PTM)的分析中仍然存在差距,特别是对于糖基化。糖基化是最常见的PTM形式,涉及大多数生物过程;因此,聚糖和蛋白质的怀了双胞胎儿子分析对于回答重要的生物学相关问题至关重要。特别感兴趣的是脑细胞外基质(ECM),其在神经科学中被称为"final Frontier",其由高度糖基化的蛋白质组成。其中,蛋白多糖(PG)含有称为糖胺聚糖(GAG)的大聚糖结构,其形成关键的ECM组分,包括神经周围网(PNN)台湾做一次试管婴儿要多少钱,显示在神经精神疾病中发生改变。因此,越来越需要将GAG(糖组学台湾做一次试管婴儿要多少钱)和PGs(蛋白质组学)分析相结合的高通量方法来揭示完整的生物学图像。这里介绍的协议集成了糖组学和蛋白质组学来分析多类生物分子。我们使用过滤辅助样品制备(FASP)型连续溶液内消化GAG类,包括透明质酸(HA),硫酸软骨素(CS)和硫酸乙酰肝素(HS),然后是肽。然后使用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)清洁和分析GAG和肽。该方案是处理组织或细胞裂解物以从同一样品中分离各种GAG类别和肽的有效且经济的方式。该方法比可用的平行(多锅)释放方法更有效(单罐),并且与使用常规蛋白质组学相比助孕,去除GAG有助于鉴定具有更高肽覆盖率的蛋白质。总体而言,我们展示了一种高通量和高效的基于质谱的糖组学和蛋白质组学分析方案(数据可通过ProteomeXchange获得,标识符为PXD017513)。
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