人类蛋白质相互作用组中癌症预后基因特征的网络特性

摘要

预后基因特征在癌症预后评估及其精确治疗中至关重要。但是，他们的网络属性仍不清楚。在这里，我们从相关出版物中获得了9个预后基因集，包括1439个不同癌症的预后基因。与基于人类蛋白质参考数据库（HPRD）和String网络的其他基因组相比，使用四个网络中心来检查预后基因（PG）的网络属性。我们还提出了三种新的网络测量方法，用于进一步研究除聚类系数之外的预后基因集（PG）的网络特性。结果表明，PG在人类蛋白质相互作用网络中不占据关键位置，与必需基因而非癌症基因更相似。然而，与随机组相比，PG具有显着更小的组内距离第三代美国试管（IAD）和组间距离（IED）（p-value

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关键词：癌症;人类蛋白质相互作用组;模块;网络属性;预后基因;预后基因组。