甘蓝中多聚半乳糖醛酸酶基因家族的扩增和表达差异模式

摘要

植物多聚半乳糖醛酸酶（PGs）通过降解果胶与植物生长发育过程中的细胞分离事件密切相关。识别和调查其进化和表达的多样化可以阐明对其功能的研究。我们对甘蓝中的PG基因进行了序列，分子进化和基因表达分析。通过系统发育分析鉴定了99个甘蓝PG（bOPG）并分成7个进化枝。外显子/内含子结构和基序在进化枝内部保守，但在进化枝之间有所不同哈尔滨试管婴儿费用。第二个保守域（GDDC）可能与PG的鉴定更紧密相关。在拟南芥和甘蓝之间至少有79个共同祖先PG。全基因组三倍体和串联重复事件在BoPG基因家族的快速扩增中起着重要作用，基因丢失可能是BoPG多样性产生的重要机制。通过评估五种组织中的表达，我们发现进化枝A，B和E中大多数表达的bOPG表现出普遍存在的表达特征，而进化枝C，D和F中表达的bOPG主要负责繁殖发育。大多数旁系同源基因对（76.2%）表现出不同的表达模式，表明它们可能经历了新功能化或亚功能化。顺式元件分析显示多达96个BOPG试管费用在其启动子中含有激素应答元件。总之，我们的比较分析可为甘蓝发育过程中BoPGs的进一步功能分析提供有价值的数据基础。

关键词：甘蓝;进化;表达分析;基因家族;多聚半乳糖醛酸酶。